Wpływ krzyżowców na wodach greckich wzrósł na początku XIII w., gdy zdobyli Konstantynopol podczas IV krucjaty, a ich dowódca, Leon Gavalas, ogłosił się dziedzicznym despotą Rodos. Rządził wyspą do 1246 r., kiedy to władzę militarnie przejęli Jankesi. I choć kilka lat później, w 1261 roku, Cesarstwo Bizantyjskie formalnie odzyskało wyspę, w rzeczywistości janusze i ich admirałowie nadal rządzili. Jeden z tych admirałów, Vignolo Vignoli, sprzedał następnie wyspy Rodos, Kos i Leros rycerzom św. Jana. Rycerze ci weszli do historii Rodos jako Johannici (dawniej zwani Templariuszami, a później znani jako Rycerze Maltańscy).

Johannici rozpoczęli budowę fortyfikacji wyspy, w tym masywnych murów i bram wokół stolicy, a także wybudowali wiele nowych budynków w samym Rodos. Założyli szpital, kwatery i pałace. Do dziś bardzo podziwianym obiektem jest tzw. Pałac Wielkich Mistrzów, który zajmował najwyższy z zakonu joannitów, Wielki Mistrz. Przez większość czasu Wielki Mistrz był rycerzem francuskiego pochodzenia, więc francuski stał się najczęściej używanym językiem tego okresu. Pod rządami joannitów Rodos ponownie stało się ważnym graczem we wschodniej części Morza Śródziemnego, a jego port ważnym ośrodkiem handlu między Wschodem a Zachodem. Największe zachodnioeuropejskie domy handlowe i bankowe otwierały na wyspie swoje oddziały.

Johanici byli świetnymi wojownikami, zarówno na lądzie, jak i na morzu. Dzięki zbudowanym przez siebie fortyfikacjom byli w stanie odeprzeć najazdy różnych zdobywców, a w XV wieku obronili wyspę przed atakiem sułtana egipskiego, a później ogromnej armii Mahometa II.

Zabytki:

Stare Miasto Rodos do dziś chronione jest przez potężne podwójne mury z głęboką fosą wewnątrz, zbudowane przez rycerzy św. Jana. Właściwie całe Stare Miasto pełne jest zabytków z czasów rycerzy - szpitali, pałaców, kościołów. Wiele z nich należy do prawdziwych skarbów dominującego tu gotyku i renesansu. W szczególności polecamy odwiedzić Pałac Wielkich Mistrzów i przespacerować się ulicą Rycerską, która wyłożona jest rezydencjami poszczególnych rycerzy. Johanici zbudowali również np. zamek na Akropolu w Lindos lub klasztor na górze Filerimos.